E.Z.N.A. Stool DNA Kit 50T试剂盒,自己翻译,仅用于交流学习。
实验之前准备:1.5ml离心管×2;2ml离心管×1;无水乙醇;冰离心管盒;常温离心管座;制冰;Elution Buffer需60-70℃预热。
所需仪器:高速离心机;70℃水浴锅;漩涡振荡器;计时器;制冰机;称量器;移液枪1ml,200µL,20µL;100ml量筒。
实验步骤:
1、加 80 mL (96%-100%) 无水乙醇至DNA Wash Buffer中以稀释。
2、在2ml离心管(自备)中装200mg glass beads。冰上预冷。使用刮刀刮取样品50-100 mg。
3、样品融化之前迅速加300µL Buffer SP1,10µL Proteinase K solution到离心管中。漩涡最大速度震荡5min直至粪便样品完全均匀。
4、70℃孵育,过程中需要通过涡旋混匀两次。共孵育13min。革兰氏阳性菌需增加90℃,5min。
5、冰上孵育2min。
6、加100µL Buffer SP2。通过漩涡震荡30s使样品混合充分。
7、冰上孵育5min。
8、13000-20000g离心5min使粪便形成颗粒状。
9、仔细地吸取上表层到1.5ml 离心管中(自备),确保避开颗粒或碎片。
10、加200µL HTR至1.5ml离心管中,使用1ml移液器充分抽吸混匀,漩涡震荡10s。
10、室温孵化2min。
11、大于13000g离心2min,目的是使抑制剂吸收HTR成颗粒状。
12、吸取250µL上清至新的2ml管中。
13、加250µL BL Buffer,250µl 无水乙醇到溶解产物中。通过漩涡震荡10s充分混合样品。
14、将上步中的整体样本包括沉淀,加到DNA柱中套上2ml收集管(提供)。大于13000g室温离心1min。弃掉液体和底部收集管。
15、将柱子安装在新的2ml收集管中(提供),加入500µL HB Buffer。大于13000g离心1min。弃掉液体和收集管。
16、将柱子安装在新的2ml收集管中(提供)。加入750µl DNA Wash Buffer(稀释过的),大于13000g离心1min。弃掉液体,将柱子重新插入空的收集管中。
17、大于13000g室温离心2min,使柱子干燥。这步很关键,除去乙醇以免干扰之后的步骤。
18、将柱子套在一个新的1.5ml管中(自备)。Elution Buffer需60-70℃预热,加200µl 直接到柱子底部的基质上。室温下浸润2min。大于13000g离心1min。
DNA提取完成后:
检测DNA质量:双蒸水洗涤,TE缓冲液调零,取5µl DNA经过TE缓冲液稀释至1000µl,釆用紫外分光光度计分别检测总DNA在260nm和280nm两处的吸光度,得到总DNA的浓度和OD 260/OD280的比值,若该比值在1.6-1.8之间,说明样品的DNA的纯度较高,无蛋白质和RNA污染;若比值<1.6,说明有蛋白质污染;若比值在1.8-2.0之间,说明有RNA污染。
检测DNA纯度:琼脂糖凝胶电泳法。称取0.36g琼脂糖,放入锥形瓶中,加入60ml TAE缓冲液,保鲜膜封口,置微波炉加热至完全澄清透明取出摇匀,加EB,倒入槽凝固呈胶。DNA样品与buffer混匀后点样,跑胶,紫外灯下观察条带。
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