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猪传染性胃肠炎病毒实时荧光定量PCR检测方法的建立及应用

时间:2022-12-17 10:38:35    下载该word文档
猪传染性胃肠炎病毒实时荧光定量PCR检测方法的建立及应

李子祥;邵春艳;徐琦;孙静;姜胜;何海建;吴媛;王晓杜;宋厚辉
【摘要】针对猪传染性胃肠炎病毒(TGEVS基因的保守序列设计引物,TEGV苗毒株为模板,克隆S基因,并构建重组阳性质粒,优化反应体系和扩增条件,建立基SYBRGreenⅠ染料的实时荧光定量PCR检测方法,并对其特异性、重复性和灵敏度进行分析.结果显示:建立的检测方法灵敏度可达10拷贝/μL,标准曲线线性关系良好(r=0.997,扩增效率高,具有良好的特异性和重复性.使用该方法对124份临床疑似TGEV病料进行检测,阳性样本有17,检测样本的阳性率为13.7%.该方法可用于兽医临床上TGEV的快速检测和流行病学分析.%Inthisstudy,areal-timePCRmethodwasdevelopedforTGEVdetectionusingSYBRGreenIdye.TheprimersweredesignedaccordingtotheconservedregionofTGEVSgene.ThespecificsequencewasclonedusingtheattenuatedTGEVstrainasatemplate.Thepositiverecombinantplasmidwasconstructed.TheamplificationsystemandconditionsofrealtimePCRwasoptimized.Thenthesensitivity,specificityandrepeatabilityofthisassaywereanalyzed.Theresultsshowedthatthesensitivityofthisassaywas10copies/μLofcDNAplasmid,thecorrelationco-efficientofthestandardcurvewas0.997.Atotalof124clinicalsamplesweretestedbythismethod,with17positiveresults.ThepositiverateofTGEVwas13.7%.Inconclusion,thismethodprovidedatechnicalsupportforlaboratorydiagnosticandepidemiologicalsurveyofTGEV.

【期刊名称】《河南农业科学》【年(,期】2017(046003【总页数】5(P129-133
【关键词】猪传染性胃肠炎;实时荧光定量PCR;特异性;敏感性【作者】李子祥;邵春艳;徐琦;孙静;姜胜;何海建;吴媛;王晓杜;宋厚辉
【作者单位】浙江农林大学动物科技学院,浙江临安311300;浙江农林大学动物科技学院,浙江临安311300;浙江农林大学动物健康检测中心,浙江临安311300;浙江农林大学动物科技学院,浙江临安311300;浙江农林大学动物科技学院,浙江临安311300;浙江农林大学动物健康检测中心,浙江临安311300;浙江农林大学动物科技学院,浙江临安311300;浙江农林大学动物健康检测中心,浙江临安311300;金华职业技术学院农业与生物工程学院,浙江金华321007;金华职业技术学院农业与生物工程学院,浙江金华321007;浙江农林大学动物科技学院,浙江311300;浙江农林大学动物健康检测中心,浙江临安311300;浙江农林大学物科技学院,浙江临安311300;浙江农林大学动物健康检测中心,浙江临安311300
【正文语种】【中图分类】S855.3
猪传染性胃肠炎(TGE是由冠状病毒科的猪传染性胃肠炎病毒(TGEV引起的一种高度接触性胃肠传染病,主要侵害仔猪,病猪表现为呕吐、严重腹泻、脱水及迅速消瘦等症状,其中,2周龄以内仔猪患病后死亡率可达100%。世界动物卫生组织(OIE将其列为B类疫病中必须检疫的猪传染病[1]。我国最早于1956年在广东报道该

病,目前,TGE在全国各地均有发生,个别养殖场TGE发病率甚至高达72.5%[2]给养猪业造成了严重的经济损失。随着集约化养殖程度的提高,该病的发生呈明显加重的趋势,且常与猪流行性腹泻病毒(PEDV和猪轮状病毒(RV等混合感染[3-4]使得病情更加严重,而单纯依靠临床症状很难对该病进行鉴别诊断。因此,急需建立一种快速、灵敏和特异的检测方法,为TGEV的实验室诊断提供依据。目前,针对TGEV的核酸检测方法,农业部于2015年出台了TGEV诊断技术标准(SN/T5482015,辽宁、江苏和广西等省也出台一些地方检测标准,但这些标准采用的检测方法均是普通PCR方法,操作繁琐、耗时长、灵敏度低,不能满足目前临床检测的需求。实时荧光定量PCR是目前应用广泛的病原检测技术,该方法具有操作简单、灵敏度高、特异性好、可准确定量、不易产生交叉污染和检测过程短等优点。为此,针对TGEVS基因序列上的保守区域设计荧光定量PCR物,采用SYBRGreenⅠ荧光染料检测方法,优化反应体系和扩增条件,建立针TGEV的实时荧光定量PCR检测方法,以实现样品从核酸到结果判定的一步法检测,旨在为TGEV的临床诊断、疫病监控和流行病学调查等方面提供新的快速检测技术。1.1毒株
TGEV疫苗(华毒株PEDV疫苗(CV777RV疫苗(NX、猪瘟病毒(classicalswinefevervirusCSFV疫苗(C、猪伪狂犬病毒(porcinepseudorabiesvirus,PRV疫苗(Bartha-K61、猪圆环病毒2(porcinecircovirustype2,PCV2疫苗(LG均购自中国兽医药品监察所。1.2病料采集与保存
于浙江省各大规模化猪场采集呕吐、腹泻症状的仔猪粪便或病死猪的小肠内容物,共计124份,置于-80℃冷冻保存。1.3试剂

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