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总DNA提取
1溶菌酶+蛋白酶K法：取500uL经预处理的菌悬液于1．5mL无菌离心管中，加20mg／mL溶菌酶25uL，37℃温浴，45min；再加入50uL，10％SDS和15uLl0mg／mL蛋白酶K，55℃水浴1h并适时摇动混匀；之后，再依次用等体积酚、苯酚：氯仿：异戊醇(25：24：1混合液、氯仿进行抽提，收集上清；再加入l／l0体积的3mol／L醋酸钠及2倍体积的预冷无水乙醇，混匀后予一20℃静置30min以上；离心弃上清，沉淀用75％乙醇洗涤、干燥；最后溶于l00uL无菌双蒸水中，并加入终浓度为20mg／mL的RNA酶A，37℃放置30min，然后于一20℃保存，备用。
2改进CTAB法：取500uL经预处理的菌悬液于1．5mL无菌离心管中，加入20mg／mL溶菌酶l2uL和1uLRNase(1mg／mL，冰浴1h，并间隔l0min混匀1次；取出置于一20℃下静置20min后，放人68℃中水浴10min，加入10％SDS53uL，继续于68℃下水浴l5min；接着加入5mol／LNaCl87uL，CTAB／NaCl(1％CTAB，0．73mol／LNaCl69uL再于68℃下水浴l5min；取出后，于一20℃下静置30min；之后，用等体积的氯仿／异戊醇(24：1进行抽提取上清，重复该步骤l次；然后加入1／l0体积的3mol／L醋酸钠及2倍体积的预冷的无水乙醇，并于一20℃静置30min，然后离心弃上清；沉淀用70％乙醇进行洗涤，干燥后，沉淀溶于100uL无菌双蒸水中并加入RNase使其终浓度为20ug／mL，于37℃消化30min，最后于-20℃保存，备用。
3试剂盒法：称取200m9粪便样品用于DNA提取，具体步骤见QIAampDNAStoolMiniKit试剂盒说明书。所得DNA溶于l00uL无菌双蒸水中，于-20℃保存。
4二氧化硅法：取500uL经预处理的菌悬液于l．5mL离心管中，加入10肚L裂解液(蛋白酶K10099；0．05mol／LEDTA400uL；1mol／