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粪便细菌DNA的提取
1.0.2-0.5g粪便置于Ep管中(冰水浴),加入1mlPBS,漩涡振荡混匀,200xg离心5min,取上清,冰水浴;
2.向沉淀中加入1mlPBS,重复步骤1
3.混合两次上清,用300g离心5min,弃沉淀;
4.两次上清用10000rpm离心8min,沉淀菌体;
5.所得沉淀用1mlPBS洗涤至上清无色;
6.-20℃过夜;
7.Ep管中加入500ulDNA提取液,6ul蛋白酶K,37℃摇床160rpm40min再加入56ul20%SDS,65℃条件下水浴2h,每隔15-20min轻摇Ep管;
8.等体积酚/氯仿抽提,8000rpm离心10min,取上层水相,重复两次,除净蛋白;
9.0.6倍体积异丙醇沉淀DNA12000rpm离心10min(4℃)
10.70%乙醇洗涤DNA沉淀两次,自然干燥;
11.沉淀中加入15ulTE,在37℃孵育箱中孵育30min


DNA提取液(pH8.0
100mmol/L
Tris-HCL100mmol/LNa2EDTA100mmol/L磷酸钠
1.5mol/L
NaCL1%CTAB100ml提取液含CTAB1g
Tips
DNA可在4℃贮存6个月,-20℃保存时间更长,但要注意避免反复冻融,以免剪切高分子量DNA
混匀时不要用力振摇,以免DNA断裂。
Tris饱和酚:氯仿:异戊醇=25:24:1

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